Análisis de Comunidades Ecológicas (BIOL 6997: laboratorio)
Instructor: Profesor J. Danilo Chinea Oficina:
B-050
Dirección
electrónica: chinearum@hotmail.com Teléfono:
832-4040, x-3913
Página
de Internet: http://www.uprm.edu/biology/profs/chinea/
Página
del curso: http://www.uprm.edu/biology/profs/chinea/comunidades/comunidades.htm
Horas
de oficina: lunes 1:00-3:00 PM; martes 9:00-10:30 AM y
1:00-3:00 PM.
Número
de Créditos: 1 crédito (2 horas de laboratorio a la semana)
Objetivos
generales:
Los estudiantes aprenderán a:
1.
Definir los tipos de
matrices de datos para el análisis de comunidades ecológicas
2.
Diseñar esquemas de muestreo
apropiados para el análisis e interpretación de comunidades ecológicas
3.
Seleccionar adecuadamente entre
varias medidas de similaridad entre comunidades para el análisis deseado
4.
Seleccionar adecuadamente
varios tipos de transformaciones de datos
5.
Agrupar jerárquicamente
datos de comunidades
6.
Analizar adecuadamente e
informar los resultados correctamente de varios métodos de ordenación de
comunidades (análisis de componentes principales, escalamiento multidimensional
no-métrico, análisis de correspondencia, y análisis canónico de
correspondencia)
Libro
de texto y lecturas:
El
libro de texto a utilizarse en este laboratorio es el mismo utilizado para la
clase:
McCune, B. and J.B. Grace 2002. Analysis of
Ecological Communities. MJM Software Design, Oregon.
Pueden comprar este libro por Internet en:
http://home.centurytel.net/~mjm/book.htm
También se utilizará el material de ayuda (menú
de “Help”) accesible desde el programa PCOrd.
Evaluación
de Estudiantes:
Informes de laboratorio – En los periodos de
laboratorio ustedes van a utilizar datos que provee el programa que
utilizaremos (PCORD) para el análisis que corresponda a cada periodo. Los
informes de laboratorio consistirán de los resultados, y las interpretaciones
de esos resultados. Los informes acumularán un total de 50 puntos. Estos
informes deben entregarse no más tarde del periodo de laboratorio que siga al
laboratorio en que yo lo asigne.
Proyecto de investigación – Cada
estudiante debe conseguir un conjunto de datos para su proyecto de
investigación, y presentar el mismo durante el periodo de examen final. Este
proyecto acumulará 200 puntos: 50 por una pre-propuesta, 50 por la propuesta
formal, 50 por la presentación oral y 50 por la presentación en formato
MSPowerPoint (modificada según las sugerencias que les entregaré el día de la presentación
oral).
Asistencia
a clase:
La
asistencia puntual a clase y laboratorios es obligatoria.
Sistema
de calificación:
A - excelente
(90-100%)
B - bueno (80-89%)
C - regular (70-79%)
D - deficiente
(60-69%)
F - fracasado (menos
de 60%).
Nota: Después
de identificarse con el profesor y la institución, los estudiantes con
impedimento recibirán acomodo razonable en sus cursos y evaluaciones. Para más
información comuníquese con Servicios a Estudiantes con Impedimentos en la
Oficina del Decano de Estudiantes (Q-019), 787-265-3862 ó 787-832-4040 x 3250 ó
3258.
Temas de clase y laboratorio (el orden es tentativo):
11/1 Introducción
y requisitos
18/1 Datos de comunidades
y diseño muestral
25/1 Medidas de
similaridad/disimilaridad (distancia)
1/2 Transformaciones de datos
8/2 Clasificación de comunidades
15/2 Clasificación jerárquica;
entregar pre-propuesta y datos para
proyecto.
22/2 Ordenación de
comunidades
29/2 Análisis de
componentes principales
7/3 Escalamiento multidimensional no-métrico
14/3 Promediación
ponderada; entregar propuesta
Receso
28/3 Análisis de
correspondencia
4/4 Análisis de
correspondencia sin tendencia
18/4 Análisis canónico de
correspondencia
25/4 Análisis de especies
indicadoras; Procedimientos
de multirespuesta por permutación
2/5 Proyecto de
investigación.
Semana de exámenes finales: Presentación oral del proyecto de
investigación