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Universidad de Puerto
Rico
Recinto
Universitario de Mayagüez
Colegio de
Artes y Ciencias
Departamento
de Biología
-
Información general:
Número de curso: BIOL 5759
Título del curso:
Laboratorio de genética bacteriana
Horas crédito: dos
horas crédito. Dos periodos semanales de 4 horas cada
uno.
2.
Descripción del curso:
En el curso de BIOL
5759 se discutirán técnicas para el estudio de la genética de las
bacterias y los bacteriófagos. Experiencias prácticas en los procesos de
recombinación, complementación, control de la expresión genética y
transmisión de información genética entre microorganismos.
3. Pre/Co
–requisitos: BIOL 5758
4.
Requisitos:
Se espera que el
estudiante:
(1)
Asista a todas las secciones de laboratorio de manera puntual. De
ausentarse, traer la justificación pertinente y excusa médica si así
aplica el caso.
(2)
Realice todos experimentos, las lecturas asignadas y trabajos
relacionados como lo son el portafolio y el mini-proyecto.
(3)
Apruebe satisfactoriamente los exámenes y pruebas cortas para
obtener así crédito por el laboratorio.
5.
Propósito y objetivos del curso:
Al final del semestre
se espera que el estudiante:
a.
Usando variadas estrategias físicas, químicas y enzimáticas, aisle
DNA de distintos grupos microbianos.
b.
Cultive y Manipule bacteriófagos y use los mismos para realizar
pruebas de complementación genética.
c.
Usando medios de cultivos especializados e inducción enzimática,
seleccione y monitoree la presencia o ausencia de genes necesarios para el
crecimiento bacteriano.
d.
Manipule y transfiera elementos transponibles entre bacterias y los
utilice como herramienta para inactivar genes.
e.
Usando cepas bacteriana especializadas demuestre la transferencia
de genes mediante los procesos de transformación, conjugación, y
transducción.
f.
Usando agentes químicos y físicos, inactive genes involucrados en
procesos fisiológicos bacterianos.
g.
Usando herramientas de ingeniería genética, detecte, aisle y
compare DNA de diversos genes y microorganismos.
6.
Políticas Universitarias, Departamentales y recursos
Asistencia a clase, ausencia a
exámenes, bajas, ética etc. seguirá lo descrito y aprobado en la Política
Universitaria y Departamental (véase Http://www.uprm.edu/biology/cursos/BIOL%205758.html).
7. Bosquejo de
contenido y distribución sugerida del tiempo
Temas y ejercicios de
laboratorio Fecha
y Tiempo (hrs)
1. Orientación general,
precauciones, preparación de medios,
4
amortiguadores y uso de
equipo.
2. Aislación de DNA genómico
bacteriano.
8
3. Plásmidos: aislamiento y
purificación.
4
4. Amplificación de diversos
genes usando “Polymerase Chain Reaction”. 8
5. Enzimas de restricción:
tipos, usos como herramientas en ingeniería
genética.
4
6. Discriminación entre grupos
microbianos usando Restriction Fragment Length
Polymorphism (RFLP).
4
7. Clonación: tipos,
usos.
8
Selección de ideas
para mini-proyectos
Examen I
8. Electroporación,
transformación natural y química.
8
Entrega primer
borrador de pre-propuesta de mini-proyecto
9. Selección, contraselección
y
monitoreo.
4
Entrega propuesta
final de mini-proyecto
10. Manejo, aislamiento y
enumeración de bacteriófagos. Complementación
8
usando el bacteriófago
T7.
11. Conjugación
utilizando Escherichia coli y
Rhodobacter sphaeroides.
8
Inicio de
mini-proyectos
12. Transducción
utilizando Salmonella y el
bacteriófago P22.
4
13. Análisis de secuencias de
DNA in silico usando herramientas
de Bioinformática.
4
14. Uso y manipulación de
transposones
4
15. Técnicas especiales:
desarrollo de bibliotecas genómicas.
8
16. Técnicas especiales (Southern).
8
17. Mutagenización.
4
18. trabajo final y
presentaciones orales de
Mini-proyectos.
8
Examen II
Total hrs 96 hrs
8. Estrategias
instruccionales
Se utilizarán una variedad de
estrategias instruccionales entre las cuales se encuentran:
a. Uso de mapas
conceptuales
b. Análisis de
situaciones
c. Trabajo en
equipo
d. Conferencia y
demostraciones
9. Recursos de
aprendizaje
El laboratorio de Biol 5759
cuenta con la instrumentación necesaria para realizar los ejercicios de
laboratorio adecuadamente. Entre los mismos se encuentran:
a. Equipo completo
para electroforesis (cámaras, fuentes de poder etc.)
b. Materiales
usados en ingeniería genética (cepas, plásmidos, enzimas de
restricción
entre otras).
c. “Thermocycler”
d.
Espectrofotómetro
e. Cámaras de
crecimiento
f. Baños de
agitación con ajuste de temperatura
g. Centro de
cómputos con acceso a internet
h. Microcentrífuga
El estudiante
deberá adquirir una bata de laboratorio para poder asistir al mismo.
Se recomienda al
estudiante traer además un marcador indeleble de punta fina.
10. Estrategias de
evaluación:
El laboratorio de
genética de bacterias se evaluará basada de la siguiente manera:
1.
Dos exámenes (100 pts c/u) 200 pts (25%)
2.
Informes y pruebas cortas 100 pts (25%)
3.
Mini-Proyecto de investigación 100 pts (25%)
4.
Portafolio virtual 100 pts (25%)
11.
Sistema de calificación:
100 - 90 A
89 - 89 B
79 –70 C
69 - 60 D
59 - 0 F
12. Bibliografía:
Libros de texto y otros recursos:
Maloy R.S., J.E. Cronan,
and D. Freifelder. 1994. Microbial Genetics.
Jones and bartlett Publishers.
(disponible como referencia en
oficina del profesor).
Beckwith J. and Sihavy T.J. 1992.
The power of Bacterial Genetics. Cold Spring
Harbur. (disponible como referencia en oficina del profesor).
Benfell P.N. 2001. Gene discovery
lab. Thomson Learning. USA. (disponible
como referencia en oficina del profesor).
Miller J.H. 1992.
A short course in Bacterial
Genetics: A laboratory Manual and Handbook for Escherichia coli and
Related Bacteria.
Cold Spring Harbor. (disponible
como referencia en oficina del professor).
Sambrook, J., and D.W. Russel. 2001.
Molecular cloning: A Laboratory Manual 3rd Ed. Cold
Spring Harbor Laboratory Press, New York. (disponible como referencia en
oficina del professor).
Snyder L. and Champness W.
1998. Molecular genetics of Bacteria. ASM
Press. Molecular genetics of bacteria. 3rd ed.
John Wiley and Son, New York. Dale, J.W. (disponible como
referencia en oficina del profesor).
Tren
N, and J. Trempy. 2004. Fundamental Bacterial Genetics.
Blackwell Publishing. MA, USA. (disponible
como referencia en oficina del profesor).
Watson, J.D., T.A. BAker, S.P.
Bell, A. Gann, M. Levine, and R. Losick. 2004.
Molecular Biology of the gene. 5th ed. Benjamín Cummins. (disponible
como referencia en oficina del profesor).
Utilizaremos bases de datos
para análisis de secuencia tales como: GenScan, ScanProsite, BLAST, COG’s,
MulAlin, CDD y otros. (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/).
13. Derechos de
estudiantes con impedimentos
Después de identificarse con el profesor y la institución, los
estudiantes con impedimento recibirán acomodo razonable en sus cursos y
evaluaciones. Para más información comuníquese con Servicios a Estudiantes
con Impedimentos en la Oficina del Decano de Estudiantes (Q-019),
787-265-3862 ó 787-832-4040 x
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