BIOL 3010L

Ejercicio #2

 Espectrofotometría de para-nitrofenol

 

INTRODUCCIÓN

 

Uno de los instrumentos principales del laboratorio de biología celular es el espectrofotómetro.

 

 

                                               

 

 

Este instrumento tiene la capacidad de proyectar un haz de luz monocromática (de un largo de onda particular)  a través de una muestra y medir la cantidad de luz que es absorbida. Esto le permite al fisiólogo realizar dos funciones:

1.      Nos da información sobre la naturaleza de la sustancia en la muestra. Esto podemos lograrlo midiendo la absorbancia a distintos largos de onda y graficar estos valores en función del largo de onda, formando un espectrograma. Como cada sustancia tiene unas propiedades espectrales únicas, distintas sustancias producen distintos espectrogramas. Esto se debe a que cada sustancia tiene un arreglo tridimensional de átomos particular que hace que cada sustancia tenga características únicas.

2.      Nos dice cuanta cantidad de la sustancia que nos interesa está presente en la muestra. La concentración es proporcional a la absorbancia, según la Ley Beer-Lambert:

 

Abs = K C L                Abs: absorbancia

                                    K: coeficiente de extinción molar

                                    C: concentración

L: distancia que viaja la luz a traves de la muestra. (normalmente es de 1 cm)

 

La cuveta promedio, que guarda la muestra, tiene dimensiones internas de un centímetro (L).  La ecuación describe una línea recta, donde el origen es cero, bajo condiciones ideales. Si L es constante (1.0 cm) y se conoce el valor de K,  podemos calcular C en base a Abs:                    Abs / K L = C         

 


El coeficiente de extinción se determina realizando una serie de diluciones de la sustancia de interés. Luego se mide la absorbancia de cada muestra de dilución a un largo de onda determinado. Los valores de absorbancia son graficados en función de la concentración. El resultado debe ser una línea recta. La pendiente de la línea (Δy/Δx) es el coeficiente de extinción (K). Si las unidades de concentración son en moles, entonces la constante es llamada coeficiente de extinción molar y se mide en unidades de /M cm.

 

 

 


 

 

 


           


           

                                                                                     


           

 

La dilución en serie se hace usualmente preparando seis o siete tubos con un volumen dado de solvente, digamos 1 ml, en cada uno. Al primer tubo se le añade un volumen igual (1 ml) de la muestra de interés y se mezcla bien. El tubo tendrá entonces una proporción 1:1 de solvente a sustancia experimental. Es muy importante mezclar bien para distribuir uniformemente las moléculas de la sustancia experimental. De otra forma, habría incongruencias en las lecturas de absorbancia. De ese tubo 1 se saca un volumen (1 ml) y se echa al tubo 2. Se mezcla bien, y se sigue el proceso con todos los tubos del 3 al 6 ó 7. Al llegar al último, se descarta un volumen de la solución diluída. Al hacer esto obtendermos una dilución en factor de dos: ½ x ½ x ½ x ½ x ½ x ½ x ½, donde un tubo tiene la mitad de la concentración de la sustancia de interés que el tubo anterior.

 

V1C1 = V2C2 , donde V1 y C1 son el volumen y la concentración de la solución que va a ser diluída, mientras que V2 y C2 son el volumen y la concentración de la dilución.

 

Un error bien común en este procedimiento es el cambiar inadvertidamente los tubos de orden. Es por ello que cada tubo debe estar debidamente rotulado. Otro problema que se presenta es la contaminación con otras sustancias o partículas de polvo. Es por ello que los tubos deben manejarse con cuidado para evitar contaminantes y asegurarse de que están bien limpios antes de usarse. Recuerden que toda materia presenta absorbancia, y si la muestra presenta partículas extrañas, estas alterarán la lectura real de absorbancia. En nuestro caso el aparato hará el ajuste para las moléculas de agua, pero leerá la absorbancia de todo lo demás.

 

El espectrofotómetro mide la absorbancia de una muestra en los espectros de luz uv y visible (200 a 850 nm). El largo de onda es determinado por un prisma que descompone el rayo de luz de acuerdo al largo de onda escogido. Luego la luz pasa por una hendidura que determina la intensidad del haz. Este atraviesa la muestra y llega a un tubo fotográfico, donde es medido. La cantidad de luz que atraviesa la muestra es el % de tramitancia. Podemos usar esta unidad o cambiarla a absorbancia usando la siguiente ecuación.

 

            %T = - Log Abs.

 

El espectrofotómetro nos puede dar ambos valores a la misma vez, ahorrando la necesidad de hacer los cálculos. (Tramitancia= cantidad de luz que atravieza la mezcla; Absorbancia= cantidad de luz que rebota contra las moléculas suspendidas en la muestra y por lo tanto no la atraviezan: es absorbida).

 

Una característica del instrumento es la necesidad de “blanquear” el aparato antes de cada lectura. Esto se hace colocando una cuveta con una solución control que tenga todos los componentes de la reacción menos la sustancia que va a ser medida en el instrumento y ajustando la lectura a cero absorbancia. El propósito de esto es eliminar el registro de absorbancia (background) que puedan presentar los demás componentes de la reacción a ese largo de onda particular. Todas las moléculas presentan absorbancia porque todas interfieren con el paso de los fotones de luz. Al Blanquear lo que hacemos es calibrar el aparato para que al tomar la lectura obvie el registro de absorbancia de aquellas moléculas que no sean las que mos interesan.

La absorbancia será óptima a un largo de onda de luz específico para cada tipo de molécula. En este experimento ensayaremos el proceso por el cual se determina la absorbancia óptima de una sustancia.

 

 

PROPÓSITO DEL EXPERIMENTO:

 

            Determinar las propiedades espectrales de una sustancia orgánica: paranitrofenol.

            Aprender a trabajar con un espectrofotómetro de luz uv/visible.

            Repasar conversión de unidades de concentración.

            Repasar la construcción correcta de una gráfica. ESTO ES MUY  

            IMPORTANTE PARA FUTUROS EJERCICIOS.

            Repasar notación científica.

 

 

MATERIALES:

            Soluciones de paranitrofenol:  100 μM y 50 μM, diluídas en agua destilada

            Agua destilada

            Tubos de ensayo LIMPIOS (Asegurarse de que no tienen partículas)

            Porta-tubos (rack)

            Cuvetas para espectrofotómetro (2 por grupo)

            Espectrofotómetro

            Kimwipes, (Usar sólo para limpiar las cuvetas y los emisores del aparato)

            Papel toalla ( para secar los derrames)

 

 

PROCEDIMIENTO:

            En grupos de 4 personas

 

Parte I: Determinar el largo de onda que registre la mayor lectura de absorbancia.

1.      Preparar una solución de paranitrofenol a 50 μM, o usar la que está ya preparada.

2.      Preparar un blanco control usando el mismo solvente en que se encuentra el paranitrofenol, pero que no contenga este reactivo. (en este caso,AGUA DESTILADA)

3.      Blanquear el espectrofotómetro con el blanco control.

4.      Tomar lecturas de absorbancia desde 260nm a 605 nm, cada 15 nm, “blanqueando” el aparato con el control antes de cada lectura, usando cuvetas de 1 ml.

5.      Determinar dónde está el pico más alto.

6.      Repetir las lecturas alrededor del pico, 15 nm por debajo hasta 15 nm por arriba del pico, en incrementos de 5 nm. Usar la tablita que no tiene anotados los largos de onda  para anotar los largos de onda de su pico y las lecturas de absorvancia cada 5 nm.

7.      Preparar una gráfica que ilustre el espectro de absorbancia amplio del paranitrofenol, y otra que ilustre el pico.

 

 

Parte II: Determinar el coeficiente de extinción molar de paranitrofenol a 410 nm (o el pico de absorbancia obtenido).

1.      Preparar una dilución en serie de paranitrofenol, que vaya desde 100 μM hasta completar 6 tubos de dilución.

2.      “Blanquear” el aparato al largo de onda escogido y tomar lectura a cada tubo de dilución. Recuerden “blanquear” antes de cada lectura.

3.     Preparar una gráfica de Abs vs concentración y  calcular el coeficiente de extinción molar para el paranitrofenol. Es importante tener en cuenta las concentraciones.

 

Parte III: Determinar la concentración de una solución con paranitrofenol.

1.      Anotar el número del desconocido asignado.

2.      Tomar lectura de absorbancia de la muestra de paranitrofenol de concentración desconocida.

3.      Determinar concentración utilizando el coeficiente de extinción calculado en la parte II.

 

 

TABLAS DE DATOS:

Parte I:

Largo de onda (Λ, nm)

Absorbancia (Abs)

Largo de onda (Λ, nm)

Absorbancia(Abs)

Λ del pico

Abs del pico

260

 

440

 

 

 

275

 

455

 

 

 

290

 

470

 

 

 

305

 

485

 

 

 

320

 

500

 

 

 

335

 

515

 

 

 

350

 

530

 

 

 

365

 

545

 

 

 

380

 

560

 

 

 

395

 

575

 

 

 

410

 

590

 

 

 

425

 

605

 

 

 

 

Parte II: Dilución en Serie

Concentracion

Absorbancia

100 μM

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Parte III: Concentración de un desconocido

 

            Desconocido #:________________

 

            Absorbancia a ________ nm: ________________

 

            Concentración estimada: __________________

 

Las siguentes instrucciones aplican a este y todos los demás laboratorios.

1.     Todas las gráficas deben estar debidamente rotuladas, con sus títulos y los ejes debidamente identificados.

2.     Incluya siempre las unidades tanto en las gráficas como en los cálculos de resultados.

3.     Tenga siempre en mente las unidades de las sustancias que han sido utilizadas y construya los ejes de acuerdo a los datos. Un eje mal construído provoca cálculos erróneos, y viceversa.

 

 

 

Los resultados deben incluir:

 

1.      Gráfica de espectrograma de paranitrofenol.

2.      Gráfica de espectrograma del pico de absorbancia.

3.      Todos los cálculos de la dilución en serie.

4.      Cálculo del coeficiente de extinción molar. (EN MOLES: cambiar la concentración de micromoles a moles)

5.      Cálculo de concentración del desconocido.