Centro de Visualización y Modelaje Molecular
Por Azyadeth Vélez Candelario
yadeth@uprm.edu
PRENSA RUM

miércoles, 18 de febrero de 2004

El Recinto Universitario de Mayagüez (RUM) podría ser la cuna para ayudar al descubrimiento de la cura de enfermedades mortales como el cáncer y el sida, entre otras, mediante los estudios que se llevan a cabo en el recién inaugurado Centro de Visualización y Modelaje Molecular que dirige la doctora Belinda Pastrana, del Departamento de Química.

Las instalaciones se establecieron con fondos del Programa de Biotecnología del RUM, el Programa PROMISE de Howard Hughes, el Instituto Nacional de la Salud a través del Centro de Investigación Biomédica de Excelencia (COBRE), del High Performance Computing Facility Program y la Universidad de Puerto Rico. Éstas cuentan con los últimos programas para modelaje de proteínas como Insight II de Accelrys, SGI Workstations e internet 2.

“Estas instalaciones se igualan a los centros de investigación en los Estados Unidos”, aseguró Pastrana. Añadió que el Centro tiene acceso gratuito a las bases de datos del Centro Nacional de la Biotecnología Informática (NCBI) en Estados Unidos, que muestran los hallazgos generados en diversos laboratorios del mundo, con los cuales otros científicos y estudiantes pueden hacer sus propias investigaciones.

La catedrática explicó que en el Centro de Visualización se trabaja con la secuencia de aminoácidos, dendogramas evolutivos, estructura, función e interacciones de las proteínas, y el diseño de drogas.

Pero, ¿por qué son importantes dichas investigaciones? De acuerdo con Pastrana, la ventaja de tener este sistema de visualización es que se pueden crear diferentes presentaciones de una o varias proteínas y ver cómo éstas interactúan. Dichas interacciones producen todos los eventos celulares y condiciones de enfermedades, tales como el cáncer, la diabetes y el sida, entre otras.

“Son todas enfermedades complejas, a largo plazo. El paciente va a estar durante 20 ó 30 años con varios medicamentos y es probable que durante ese tiempo ocurran complicaciones que lo lleven a necesitar otra droga. Y la forma en que se diseñan los medicamentos, comienza con conocer la estructura de la proteína”, explicó la científica.



Precisamente, uno de los estudios que el doctor Gustavo López, en colaboración con Pastrana, lleva a cabo en la actualidad trata sobre la simulación de modelos del surfactante pulmonar, material esencial para poder respirar.

Los datos del Centro de Visualización y Modelaje Molecular se obtienen mediante el estudio de las proteínas que se encuentran en la célula dentro o fuera de las membranas. Según detalló la química, un ejemplo es un receptor llamado “factor de crecimiento epidermal” en el cual la proteína tiene tres partes: la primera es importante para la comunicación entre células, la segunda penetra la membrana y la tercera controla el comienzo del ciclo celular que es el que se encuentra dentro de la célula (en el citoplasma). A través de la tecnología del Centro, la parte extracelular de la proteína receptora se puede observar en dos o tres dimensiones gracias a los trabajos de cristalografía de rayos x hechos por varios científicos de Estados Unidos, Australia y Japón y que se consiguen en las diversas bases de datos a las que tiene acceso el Centro.

La científica dijo que, en el caso específico del cáncer, aunque ya prácticamente el 50 por ciento de las condiciones tienen cura, se pueden lograr nuevos avances para la eliminación de otros tipos de condiciones de esta enfermedad.

Estudiantes de nivel subgraduado también utilizan el Centro, ya que según expuso la doctora, es necesario que las generaciones de futuros científicos en las áreas de bioquímica, biotecnología, biología, química e ingeniería química tengan acceso a ese tipo de información.

El Centro de Visualización y Modelaje Molecular del RUM, que está localizado en el nuevo edificio de Química en el salón Q-044, ha estado sirviendo a la comunidad universitaria por cinco años y luego de haber atendido más de mil estudiantes, fue inaugurado el pasado mes de noviembre en una actividad que contó con la participación del rector Jorge Iván Vélez Arocho; el decano de la facultad de Artes y Ciencias, doctor Moisés Orengo Avilés, entre otros miembros de la docencia y estudiantado del RUM.


El RUM podría ser la cuna para ayudar al descubrimiento de la cura de enfermedades mortales como el cáncer y el sida, entre otras, mediante los estudios que se llevan a cabo en el recién inaugurado Centro de Visualización y Modelaje Molecular.