Originalmente, la Estación estaba ubicada en una pequeña finca de 19 cuerdas dedicada a la investigación en tabaco en el Municipio de Caguas. El Gobierno de Puerto Rico propuso la permuta de esta finca por un área igual o mayor en los terrenos recién adquiridos. La propuesta fue aceptada y en el año 1953 un funcionario de la Estación Experimental Agrícola recibía los nuevos terrenos, quedando así fundada la Estación de Gurabo.
El objetivo principal de esta Estación era expandir el programa de investigaciones del tabaco, por lo que se estableció el Programa de Fitomejoramiento en dicho cultivo. Más tarde, se trasladó el Programa de Desarrollo de Variedades de Caña de Azúcar de la finca de Solís en Río Piedras a Gurabo. Para el año 1956 se transfirió la Vaquería Experimental a Gurabo y se amplió el campo de la investigación de dicha zona geográfica.