El grado de Maestría en Ciencias (MS) en Ingeniería Química en la UPRM requiere un intenso programa de estudio e investigación. Como tal, el Departamento requiere:
- La aprobación de un mínimo de 31 / según lo especificado por el programa con un GPA de 3.0 (de 4.0) o más.
- La aprobación de una propuesta de investigación.
- Realizar un proyecto de investigación tal como se indica en la propuesta.
- Aprobación de examen oral para defensa de tesis.
- Preparar un documento de tesis.

Un mínimo de 31 / para completar el grado, que se dividen de la siguiente manera: 12 / en las materias básicas de ingeniería química; 1 crédito de los seminario de maestría, 6 / en la tesis de maestría, 6 / en temas de ingeniería química no básicos, y 6 / ingeniería en sujetos no químicos. Se permite un máximo de 6 / en pregrado avanzado (es decir, 5000) a nivel de los cursos. La disciplina de la Ingeniería Química cubre muchas áreas diversas y, por lo tanto, el Departamento ofrece temas de nivel graduado para cubrir las de mayor relevancia. La filosofía del Departamento es animar a los estudiantes a desarrollar una comprensión en profundidad de los conceptos fundamentales de la Ingeniería Química y, al mismo tiempo, ampliar su perspectiva mediante el muestreo de otros temas más especializados. Con este fin, los siguientes cuatro temas han sido designados como núcleo:
- Métodos Matemáticos en Ingeniería Química (InQu 6001)
- Diseño del reactor (InQu 6005)
- Fenómenos de Transporte Avanzado (InQu 6016)
- Termodinámica Avanzada (InQu 6019)
Se espera que los estudiantes de maestría completen estas cuatro materias básicas dentro de los dos primeros años de su permanencia en la UPRM. La lista de los temas centrales será revisada periódicamente para dar cabida a los avances modernos de la disciplina. Además de estos cursos básicos, los estudiantes de maestría deben inscribirse cada semestre en el Seminario de Posgrado (InQu 6029) y después del primer año de Tesis de Maestría (InQu 6037). Un máximo de 6 / de Tesis de Maestría (InQu 6037) puede aplicarse al cumplimiento de los requisitos de crédito de maestría. Para asegurar el desarrollo académico y profesional del alumno, el Departamento requiere un mínimo de 6 / (típicamente dos cursos) en sujetos de Ingeniería Química no básicos y un mínimo de 6 / (típicamente dos cursos) en otros departamentos o disciplinas, que debe estar relacionada a la investigación de tesis del estudiante. Estos cursos deben ser seleccionados por el estudiante en consulta con su / su director de tesis.